अनुयोग जैन धर्म में शास्त्रों के अध्ययन और व्याख्या की पद्धति या विषय-विभाजन को कहते हैं। अनुयोग का अर्थ है ‘उपदेश’ या ‘प्रवचन’। जैन आगम ग्रंथों की सामग्री को समझने और पढ़ने के लिए चार प्रकार के अनुयोग बताए गए हैं:

1. प्रत्यक्षानुयोग (Prathamaanuyog): यह इतिहास और कथाओं से संबंधित है, जैसे कि तीर्थंकरों, गणधर, श्रावकों आदि की जीवनी और चरित्र कथाएँ। उदाहरण: "आदिपुराण", "उत्तरपुराण"।

2. कारणानुयोग (Karananuyog): इसमें सृष्टि, ब्रह्मांड, जीव, कर्म, पुनर्जन्म आदि के कारणों का विश्लेषण किया जाता है। यह तात्त्विक और दार्शनिक अनुयोग है। उदाहरण: "तत्त्वार्थसूत्र"।

3. चर्यानुयोग (Charananuyog): यह आचार, नियम, संयम, व्रतों, दिनचर्या आदि से संबंधित है। इसमें व्यवहार और आचार के नियम समझाए जाते हैं। उदाहरण: "आचारांग सूत्र"।

4. द्रव्यानुयोग (Dravyanuyog): यह तत्त्वज्ञान, आत्मा, परमाणु, पुद्गल, धर्म, अधर्म, आकाश आदि छह द्रव्यों का विश्लेषण करता है। इसमें तत्वों का सैद्धांतिक विवेचन होता है। उदाहरण: "समयसार", "गोम्मटसार"।

संक्षेप में: जैन धर्म में कुल चार अनुयोग माने गए हैं—प्रत्यक्षानुयोग, कारणानुयोग, चर्यानुयोग और द्रव्यानुयोग। इनसे जैन शास्त्रों का अध्ययन और शिक्षण व्यवस्थित रूप से किया जाता है।